各分支庫根據儲物不同或出入庫情況變化以及保溫性能差異,難以做到各分支庫根據自身需求,分別自動調節制冷量,對原不需要制冷的分支庫造成過度制冷的浪費現象;蒸發器除霜以及冷卻水泵運行難以達到最佳效果。
冷庫制冷設備的自動控制水平低,完全依賴於人工操作,而人的主觀能動性與技術水平等,因人因時等都有很大的差異,難以達到最佳控制。
有時會因為開機不當造成設備事故,或者因開機不及時,造成儲存物損壞或減少儲存物儲存周期,帶來重大的經濟損失。值班人員需要全天守候,帶來人工運行成本的支出,這些問題要受到重視。